現(xiàn)有檢驗科、臨床藥學、耳鼻咽喉科、心臟大血管外科、兒內(nèi)科小兒呼吸專業(yè)、普通外科、皮膚科、中醫(yī)兒科、小兒外科和急診醫(yī)學科等10個國家臨床重點?？疲约皣倚l(wèi)生計生委兒童結(jié)石病診療中心、上海市小兒外科臨床醫(yī)學中心、上海市危重孕產(chǎn)婦和新生兒搶救中心、上海市產(chǎn)前診斷中心、上海市聽力障礙診治中心以及8個上海交通大學診治中心。